石城遗址距今4000年至3400年左右，发现的遗迹主要有：石砌圆形建筑基址、半圆形建筑基址、石墙、积石台、零星墓葬等。到目前为止，城内共发掘圆形建筑基址65座、窖坑49座、积石台16座、不同时代的墓葬10座。大城发掘面积约7500平方米，城内屋舍俨然，道路通达，布局清晰。现已清理出夏家店下层文化的院落20余处，基本由单、双圈建筑基址及窖坑、石墙等设施构成，院落之间多有一条共用的院墙，呈现出遗址内诸多院落由高到低、阶梯状分布的特点。小城与大城相连，四周环列石筑的城墙，占地面积约1585平方米。考古人员分析，这种大小两城相配置的建制较为普遍。从出土遗物和城内建筑形制分析，可以肯定它们是一种共存关系，而非前后为继。这种现象应为当初先民们在规划建设聚落时，出于某种考虑而作出的选择，反映出当时人们的一种观念。

    像三座店夏家店下层文化石城这样的遗址，在辽西地区以及内蒙古境内极为少见，以往更没有大规模全面揭露挖掘的先例。

    专家评价：三座店遗址最大限度地保留着初始状态，考古工作者进行的完整揭露和清理，对于聚落考古研究来说，具有十分重要的价值。